Jacques Fantini (https://unis-neuro.com/96-membre-fantini-jacques.html)

Mon analyse moléculaire du nouveau variant Omicron

·      Ce nouveau variant apparu en Afrique australe défraye la chronique, du fait du très grand nombre de mutations dans sa protéine Spike : 30 mutations, 3 délétions et 1 insertion (en rouge dans la structure modélisée complète visible ici).
·      Afin d'en savoir plus sur sa contagiosité j'ai appliqué à ce variant l'analyse du T-index (index de transmissibilité) qui m'avait permis, dès l'apparition du variant Delta en avril dernier, d'anticiper son expansion au niveau mondial ( voir ici : https://lnkd.in/dnSDgQv ).
·      Cet index prend en compte l'interaction du domaine NTD avec les rafts de la cellule hôte, l'interaction du domaine RBD avec le récepteur ACE-2, et le potentiel électrostatique de surface qui révèle la vitesse d'attraction du virus à la cellule cible.
·      La prédominance du variant Delta s'explique, au niveau du virus, par sa valeur très élevée de son T-index : 10,67. Par comparaison, le T-index de la souche initiale (Wuhan) a un T-index de 2,16. On peut donc extrapoler que le variant Delta est environ 5 fois plus transmissible que la souche de départ.
·      Le calcul effectué pour le variant Omicron donne un T-index = 3,90. Il est donc a priori moins transmissible que Delta, qui reste à ce jour le variant possédant le T-index le plus élevé.
·      Une analyse détaillée de la protéine Spike du variant Omicron suggère que cette avalanche de mutations n'obéit à aucune logique de sélection, mais plutôt à une absence de contrôle immunologique (patient immunodéprimé ?) et/ou à des traitements antiviraux pouvant favoriser l'apparition de mutations.
·      L'affinité du RBD d'Omicron pour ACE-2 est diminuée par rapport à tous les autres variants analysés à ce jour, sans doute la conséquence de cette accumulation de mutations dans le RBD (>10 !)
·      Le succès de Delta tient à l'évolution concomitante du NTD et du RBD avec seulement 2 mutations dans chaque domaine. Pour Omicron, les mutations vont dans tous les sens, sans logique particulière, certaines s'annihilent mutuellement.
·      Les profils mutationnels du NTD et du RBD suggèrent que les anticorps neutralisants auront une activité très faible sur ce variant.
·      En revanche, l'épitope facilitant du NTD (épitope ADE) est également détruit par les réarrangements de la protéine Spike d'Omicron, ce qui souligne encore l'absence de logique dans ce profil mutationnel exacerbé.
·      Conclusion : cette analyse du variant Omicron laisse penser que ce variant ne supplantera pas le Delta.
·      N'oublions pas l'importance des interactions virus-hôte. Le polymorphisme du récepteur ACE-2 pourrait par exemple permettre des percées régionales du variant Omicron (ce fut le cas avec le variant B.1.351, qui s'est répandu en Afrique australe, mais pas en Europe).
·      Dans tous les cas, les gestes barrière restent incontournables pour tous.

Premier test antigénique ce matin. Je peux dire qu'elle a bien tapé dans le fond.

Les antivaxx allez tous bien vous faire cuire le cul.

J'ai pris mon RDV pour la troisième dose pour décembre, hier je veux aider quelqu'un à prendre son RDV rien avant fin-janvier.

➔ seiken3 - 29 Nov 2021

Par curiosité , j'ai regardé pour programmer la troisième dose. Doctolib est saturé

Edit par Yoruichi89 (29 Nov 2021)

Un mal pour un bien : j'avoue aujourd'hui être content d'avoir eu cette merde il y a moins de deux mois quand je vois l'envolé du nombre de cas...

➔ munky - 29 Nov 2021

Oh il a peur d'un petit piqûre coton-tige.

➔ sherman - 29 Nov 2021

Pas mal de centres de vaccination ont fermé ces dernières semaines, mais devraient réouvrir prochainement afin de permettre l'accès à la 3e dose. Faut checker régulièrement, ils vont probablement ouvrir des créneaux.

➔ NoVa - 29 Nov 2021

les PCR gratuits pour les vaccinés

Vous avez peut être lu l'info sur le club portugais qui a commencé le match à 9 joueurs contre Benfica car l'équipe était décimée par le covid ?

https://www.20minutes.fr/sport/3184607- … belenenses

Ils revenaient d'Afrique du Sud

Toujours en plein dedans. De la fatigue, le nez un peu pris...
Mais surtout, plus aucun odorat ou goût des aliments.

J'ai essayé un truc bien acide (swcheppes agrumes) c'était de la badoit

J'espère que cela ne dure pas trop longtemps...

https://www.leparisien.fr/faits-divers/ … OYUOTA.php

Souhaiter que les gens se responsabilisent

Oui faut être au taquet ! pour mes parents j'ai pu avoir une pharmacie (30min de chez eux quand même) pour le 17 décembre, pendant qu'elle prenait les coordonnées les créneaux disparaissaient tous on a cru qu'on pourrait pas terminer...

Ca va gueuler si les gens perdent leur pass juste à cause d'une organisation pourrie
Perso je m'en tape un peu du pass pour les parents c'est surtout qu'ils soient bien protégés avant les fêtes quoi, vu la gueule de ce pic qui passe par les gamins c'est vite fait

Les Brittons viennent d'ouvrir le rappel à tous et ont raccourci le délai à 3 mois après la 2ème dose

➔ seiken3 - 29 Nov 2021

Comme dans Warzone, une nouvelle saison chaque trimestre avec son season pass. On peut y jouer gratuitement aussi.

À propos de la troisième dose de rappel :
https://mobile.twitter.com/SaiyanBio/st … 2120138761

➔ Kotors - 28 Nov 2021

"Je suis contre le transhumanisme"

Donc il doit être pour

➔ Sephiroth972 - 29 Nov 2021

Il décompense

Je vois souvent que c'est à 260 BAU/ml qu'on est protégé à 80% contre le Covid symptomatique.

Après ma 3ème dose de mai, j'étais à 168 en octobre.

Voilà pourquoi je l'ai chopé

➔ Incognito - 30 Nov 2021

Bordel
Ne pas avoir de goût et d'odorat pendant une semaine m'avait bien saoulé mais cinq mois.

➔ - Jamais

On a déjà très peu de personne double dosées qui vont à l'hosto donc 3...

➔ sherman - 30 Nov 2021

Rapport de la Drees pour fin  octobre en France.

Il faut voir comment le rappel fonctionne en Israël (c'est encore trop frais). Mais si Israël parle de 4ème dose c'est bien parce que c'est une option envisageable en fonction de l'efficacité du rappel sur un temps plus long.

Et puis avec les histoires de nouveaux variants...

Edit par Churchill (30 Nov 2021)

➔ Mariole - 30 Nov 2021

Ca je suis d'accord, mais c'est pas le sujet. Ce que tu avances c'est l'argumentation à tenir face aux anti vax qui veulent prendre  ces chiffres d'hospitalisation comme preuve que le vaccin est inefficace.  Ce qui n'est pas le débat ici.

En définitive il y a toujours de nombreuses personnes qui entrent en hospitalisation même en étant double vacciné et il faut voir comment ça évoluera avec la 3eme sur plusieurs mois. De cela dépendra une future 4eme dose ou non.

J'evoquais la 3eme dose dès le mois d'août. Bah on y est. Et vu que tout ce qui se fait en Israël finit par être appliqué ici, on devrait ouvrir les oreilles dès que ces derniers évoquent une 4eme dose. Si ils le font on le fera aussi.

Edit par Churchill (30 Nov 2021)

➔ Incognito - 30 Nov 2021

C'est très variable la perte de l'odorat et le goût a duré 5 jours pour moi et 3 mois pour ma femme. Des personnes de la famille ça fait 1 ans et ils ont retrouvé  l'odorat que partiellement.

Edit par jotaros (30 Nov 2021)

➔ The Baygon - 30 Nov 2021

Du coup on va reconfiner ? (question sérieuse)

➔ Churchill - 30 Nov 2021

On a un meilleur taux de vaccination qu'il y a un an, voir même un taux de triple vaccination qui n'existait pas mais on a quand même plus de contamination et ce, malgré ce fabuleux outil qu'est le pass sanitaire avec son délai de validité raboté à 24 heures...

Très probablement la faute des non vaccinés once again

Vivement le confinement des non vaccinés avec l'explosion des chiffres de contamination une fois de plus pour que les plus aveugles se rendent compte de la supercherie (ou pas, la doctrine est trop forte pour certains)

Edit par Sephiroth972 (30 Nov 2021)